Муниципальное образование Городское поселение Новоаганск в соответствии с Федеральным законом от 06.10.2003 № 131 "Об общих принципах организации местного самоуправления в Российской Федерации" и законом Ханты-Мансийского автономного округа-Югры от 25.11.2004 № 63-ОЗ "О статусе и границах муниципальных образований Ханты-Мансийского автономного округа-Югры" осуществляет свои полномочия с 01 января 2006 года. В составе поселения два населённых пункта — это посёлок городского типа Новоаганск и село Варьёган, которые до этого по административно-территориальному делению относились к муниципальному образованию Нижневартовский район.
Экономические преобразования на территории нынешнего Нижневартовского района начались после того, как в 1961 году вблизи Нижневартовска геологи нашли нефть. Именно тогда вся страна узнала о Самотлоре, о новом уникальном месторождении нефти, которое стало базой для промышленного развития прилегающей к Нижневартовску территории.
В 1965 году руководство Главтюменьгеологии приняло решение об организации геофизической экспедиции для оперативного управления работой сейсмических партий на востоке Ханты-Мансийского округа. В феврале-марте 1966 года была произведена топосъёмка местности по определению места базирования будущей экспедиции. В мае того же года уже началось строительство вахтового посёлка для сейсмиков и геологов.
Официальной датой образования посёлка Новоаганск считается 19 мая 1966 года. С каждым годом посёлок обустраивался и уже в апреле 1978 года вахтовому посёлку присваивается статус рабочего посёлка, а с ноября 2004 — статус посёлка городского типа.
Новоаганск сегодня — это маленький современный городок с протянувшимися улицами новостроек. Сами новоаганцы так говорят о своей "малой родине": "Раньше — это был посёлок для того, чтобы работать, а теперь — для того, чтобы жить". На смену жилым домам в деревянном исполнении приходят 3-х, 4-х этажные дома в капитальном исполнении, асфальтированые дороги, тротуары, пешеходные дорожки, детские городки, скверики, памятники, зоны отдыха на реке Аган и озере Магы-Лор, современные Дворец спорта "Олимп" и Дворец культуры "Геолог" , новые поликлиника и стационар с современным оборудованием, автостанция — это не полный перечень объектов, которыми Новоаганск радует своих жителей сегодня.
Село Варьёган образовано на месте Варьёганских юрт, первое упоминание о которых датируется 1900 годом и содержится в трудах исследователя Северо-Западной Сибири Александра Александровича Дунина - Горкавича.
В эти годы первые переселенцы и местные жители, на месте древних стойбищ аганских ханты и лесных ненцев, объединились в артель имени Кирова, которая занималась промыслом рыбы, дичи, сбором дикоросов.
Начиная с 1935 года, село интенсивно развивается: артель переросла в колхоз им. Кирова, появилась бригада оленеводов, построена звероферма, открыт рыбоучасток, завезены коровы и лошади. В начале 60-х годов колхоз был расформирован и образовалось Варьёганское промыслово-охотничье хозяйство. Основные виды деятельности: заготовка леса, переработка дикоросов, добыча пушнины, разведение серебристо-чёрных лисиц.
С преобразованиями в Нижневартовском районе происходили преобразования и в селе Варьёган. В октябре 1989 года на территории села был образован Варьёганский сельский Совет.
Село Варьёган сегодня — это территория с развитой инфраструктурой. Здесь имеется достаточный для нормального проживания набор объектов социальн-культурного назначения: общеобразовательная средняя школа на 150 мест, интернат на 30 мест, сельский дом культуры на 100 мест, детский сад "Оленёнок" на 50 мест, этнографический парк-музей, врачебная амбулатория, торговые точки, узел связи, пекарня. Учитывая национальные особенности жителей села, для них строятся одно-, двух-, четырёхквартирные дома с приусадебными участками.
Начиная с 2004 года в селе постоянно ведутся работы по его благоустройству.
Решением Совета депутатов городского поселения Новоаганск от 22.08.2013 № 252, определена дата образования села Варьёган – год 1900, дата празднования дня села Варьёган 27 апреля ежегодно, начиная с 2014 года.
